本发明公开了一种用于无人机遥感场景的自动巡航系统和方法，属于无人机遥感领域，本发明构建飞行姿态评估模型，将无人机飞行过程中的飞行姿态数据导入飞行姿态评估模型对上个巡航区域的无人机飞行姿态进行评估，构建环境异常评估模型，将巡航区域的环境数据导入环境异常评估模型进行巡航区域的环境异常评估，通过飞行姿态评估情况和巡航区域的环境异常评估情况进行飞行危险判断，根据得到的飞行危险判断结果进行是否前往下一巡航区域的判断，根据无人机实时飞行情况和环境情况实时综合判断无人机是否满足下一巡航区域的飞行条件，提高了对无人机飞行安全性的预判能力，同时极大的避免了无人机发生异常损伤情况。