本发明提供了一种考虑可用装机容量的短期风电功率预测方法及系统。该方法包括，依据极端天气对风电功率影响机理的分析结果，得到关键气象因子；基于历史气象数据，采用映射模型，将历史气象数据映射为理论功率数据，依据历史气象数据对应的历史功率数据和理论功率数据，对功率损失预测进行直接建模，引入可用装机容量概念，基于理论功率数据和功率损失值预测结果，得到可用装机容量预测结果；分别对正常天气下的功率和关键气象因子下的功率进行数据处理，构建功率训练数据集；基于功率训练数据集，采用功率预测模型，得到功率预测结果，将可用装机容量预测结果与功率预测结果相乘，得到极端天气下风电场站功率预测结果。