本发明公开了一种背靠背直流工程两端协调功率平衡换相失败抑制方法及系统。包括：检测逆变侧交流故障，判断是否发生可能引发换相失败的交流故障；当发生所述交流故障时，逆变侧进行熄弧角调节并检测得到有功功率；整流侧根据所述有功功率，进行有功功率平衡控制；整流侧的电流控制器计算得到电流上限，进行电流限幅；当所述交流故障结束后，恢复常规控制方式。本发明采用两侧协调功率平衡的方法，利用整流侧和逆变侧两端的共同调节能力，避免换相失败和连续换相失败的发生，以解决目前已有避免换相失败的控制保护策略换相失败抵御能力有限，仅适用于轻微交流故障引发的换相失败的技术问题。