本申请提供一种近零干扰仪器设备运行状态监测系统及方法，方法包括以下步骤：监控仪器设备与上位机之间的通信端口，以获取仪器设备与上位机之间的数据传输信息；基于数据传输信息对仪器设备与上位机之间的网络活跃状态进行评价，并基于网络活跃状态的评价结果确定仪器设备的运行状态；响应于判断仪器设备与上位机之间的网络活跃状态处于交互状态，则判断仪器设备处于工作状态；响应于判断仪器设备与上位机之间的网络活跃状态处于静默状态，则判断仪器设备处于待机状态或关机状态。基于本申请提供的近零干扰仪器设备运行状态监测方法及系统，可以准确分析仪器设备的运行状态，确定仪器设备的运行机时。