本发明公开了一种嵌入式手电两用电磁屏蔽门系统，包括嵌入式门框组件、龙门支架组件、下导向轨道、可调式门槛部件、复合门扇、门扇驱动组件和滑移组件，滑移组件通过吊接臂与复合门扇连接，门扇驱动组件连接在下导向轨道上；门扇驱动组件沿着下导向轨道运动，在滑移组件的配合下实现对复合门扇开启与关闭；可调式门槛部件包括门槛主体、门槛驱动组件、升降组件、升降门槛、直线驱动组件和支撑板，支撑板滑动安装在升降门槛上，通过门槛驱动组件及升降组件带动升降门槛竖向升降、对复合门扇底部进行密封。该系统具有手动和电动两种开闭方式，可靠性较强，连接牢靠，具有较好的电磁屏蔽能力，门扇开启后的通过性较好，应用前景广。