本发明提出一种显著显示文档文字内容差异的方法及系统，属于人工智能技术领域，包括：获取两个待比较文档，并导出为PDF；输出并保存每页的文本行文字内容，将得到的文本行文字内容按规则去除指定标点符号，按文本行的坐标整理成正常阅读顺序，拼接在一起，最终两个待比较文档各得到一个长字符串，一共两个长字符串；利用寻找字符串差异的算法处理两个长字符串，得到字符串差异信息，将差异信息重新整理，得到每个字符串的差异列表；根据差异列表生成含有差异区域填充的每页文档的图片；通过本发明中的显著显示文档文字内容差异的方法，用户可以快速、直观地比较并两个文档文字内容的差异，提高了办公效率。