本发明提供一种坚硬覆盖层浅水区取砂方法，包括以下步骤：S1、根据水域的地质勘探数据优化绞吸船的工作路径；S2、当遇到坚硬覆盖层时，在绞吸船上的旋转钻头的前侧安装施力杆和冲击锤；S3、利用设置在承重架上的吊装机同时下放旋转钻头和冲击锤；S4、通过多次冲击在坚硬覆盖层的砂岩形成豁口；S5、将旋转钻头穿入到豁口内进行掏挖，使豁口内形成一定的悬空段；S6、继续破坏悬空段直至完全坍塌；S7、拆卸施力杆和冲击锤，疏浚已坍塌的悬空段；S8、疏浚完成后进入到下一区域施工。本发明施工工艺简洁，能大幅度提高整体的施工效率，保证施工的高效稳定。