本发明公开了一种河道横断面测量起点距自动量算方法。本发明自动量算方法包括：野外测量获取断面测量点，将测量点展绘于绘图软件中，用封闭多边形将不同断面上的测量点分别包围起来，绘制直线连接两个基点，利用点面叠置分析技术使每个断面测量点挂接上断面名称及两基点坐标属性，基于向量投影公式计算每个测量点投影距离，最后换算起点距，利用断面名称对起点距分组排序，输出结果。本发明方法批量实现了不同空间分布的断面起点距自动化量算，工作量较小，自动化程度较高，且最终输出内容齐全，便于数据整理。