本发明公开了一种具有容错能力的非同步行波双端测距方法及系统。该方案首先对三相电压信号进行相模变换，从而提取出线模分量，然后分析线路前半段故障(0～1/2L)与后半段故障(1/2L～L)时前两个电压行波的极性关系，进而初步判别故障区段。其次，本方案分别利用线路两端测量装置检测到的首行波与首个反极性波到达时间计算出相对应的预估故障距离，并由对端将预估故障距离传输给本端测量装置，本端接收到传信后对数据进行校对，从而实现对实际故障距离的判别。本发明针对传统行波测距无法准确测量近端故障的缺陷，通过两端测距结果进行校对，具有一定容错率。