本发明公开了一种基于FPGA的固定磁场数据监测系统，包括：若干监测单元、中继单元和上位机；所述监测单元用于测量数据，获取系统异常数据，并将测量得到的数据和系统异常数据传输至中继单元；所述中继单元用于接收并处理监测单元发送的数据，作为上位机和监测单元的信息中转装置，将串行网络转换为星型网络，将数据上传至上位机，同时实现系统的控制；所述上位机用于实时显示与分析中继单元上传的数据。本发明实现了高精度、低延迟磁场数据和姿态数据水下磁场监测，具有高速率、高可靠、低时延，以及小型化、低成本、自主可控全国产化的特点。