本发明公开了一种基于二维码的河湖健康信息管理系统及方法，具体涉及河湖信息管理技术领域，通过在河湖区域设置多个二维码匹配点，结合定位和时间分析，基于对二维码的损失信息和扫描效率信息进行综合分析，评估二维码匹配点的使用风险，根据近期二维码匹配点的使用风险的趋势变化，判断二维码匹配点的使用状况是否正常，当巡视信息采集任务的可信度达标，且二维码匹配点的使用状况正常时，将河湖信息保存至二维码对应的链接；能够提高河湖信息采集的准确性、可信度和时效性，为河湖管理提供了可靠的数据支持，促进了科学决策和资源合理利用。