本发明公开了一种基于数据分析的集装箱病媒生物检测方法及系统，涉及集装箱病媒生物检测技术领域，包括计算获得集装箱来源地的历史风险系数和实时风险系数，并进一步计算获得来源地病媒生物风险；获取集装箱完整标志个数、历史携带病媒生物数量和携带病媒生物集装箱比例，计算获得集装箱病媒生物风险；获取各个来源地病媒生物风险和集装箱病媒生物风险，计算获得集装箱病媒生物评估系数，并依据集装箱病媒生物评估系数选择不同的病媒生物预警处理策略。提供一个综合性的评价指标，用于评估集装箱携带病媒生物的风险程度，优先处理风险较高的集装箱，确保有限的防控资源得到合理分配，提高防控工作的针对性和效率。