本发明短小芽孢杆菌在预防与治疗阿尔茨海默病中的应用，提供一株短小芽孢杆菌菌株，保藏编号为CMCC(B)63202。本发明通过实验证明，短小芽孢杆菌在脑部注射Aβ寡聚体诱导的阿尔茨海默病模型小鼠中，能够改善AD模型小鼠的空间学习记忆障碍以及自主探究能力，增加小鼠血清的谷胱甘肽含量和超氧化物歧化酶酶活力、降低丙二醛含量，进而提出短小芽孢杆菌对阿尔茨海默病具有很好的预防及治疗作用，为开发预防与治疗阿尔茨海默病有关的药物提供了新的途径。