本发明提供一种灌注装置及导管泵系统，所述灌注装置包括输出切换机构、进液口、出液口以及至少两个容积可调的容置腔；至少两个所述容置腔被所述输出切换机构分隔开；所述输出切换机构被配置为，依次切换至少两个所述容置腔与所述进液口和所述出液口的连通关系；其中，切换至少一个所述容置腔仅与所述进液口连通的同时，切换至少另一个所述容置腔仅与所述出液口连通；并且，与所述进液口连通的所述容置腔及与所述出液口连通的所述容置腔被配置为同步地改变容积，且容积改变的趋势相反。如此配置，可实现连续输出灌注液。此外，在实施灌注时，输出灌注液的容置腔与进液口是不连通的，有利于精准控制灌注液的流量。