本发明公开了一种燃料电池车辆的制动电阻冷却系统、八通阀以及控制方法，包括内部设置有水泵以及水冷循环的燃料电池系统；燃料电池散热器一，设置于燃料电池系统的一侧，用于对燃料电池系统进行散热；制动电阻系统；燃料电池散热器二，设置于制动电阻系统的一侧；八通阀，八通阀与燃料电池系统、燃料电池散热一、制动电阻系统以及燃料电池散热器二相连通。本发明可以实现制动电阻和燃料电池回路最大化共用散热器，节省整车散热器布置空间及成本。还可以实现制动电阻和燃料电池的完全独立工作回路，实现制动电阻工作时，燃料电池保持在怠速功率点，避免频繁开关机。