本发明公开了一种桌面式自动化微流控合成装置，该装置包括：边缘智能处理器i.MX 8M PLUS系统、微控制器STM32H7系统、显示器、电源管理模块、异常警示模块、高清摄像头、温控模块、压力传感器、背压阀、注射泵组、试管阵列、多通阀组及微流控芯片。本发明既适用于微流控反应路线的验证和反应数据库构建，也适用于基于微流控芯片的连续流制备。通过将微流控芯片和自动化技术有机结合，本发明能够大幅简化微流控反应中的人工操作，提高实验的准确性和可重复性。同时，装置可以从多维度全程记录实验过程，为实验结果分析提供更全面的支持。本发明对微流控实验和合成效率提高有着积极推动作用。