本发明公开了一种南美白对虾抗弧菌病性状相关的BBOX1基因分子标记，其包括分子标记A、分子标记B和分子标记C中的任意一种或多种，所述分子标记均位于南美白对虾gamma‑butyrobetaine dioxygenase基因序列上；本发明利用所述分子标记作为南美白对虾抗副溶血性弧菌性状的功能标记，通过提取待测南美白对虾肌肉组织的基因组DNA，再将其作为模板DNA进行PCR扩增以及PCR扩增产物纯化，然后对得到的产物进行测序，确定所述的分子标记A、分子标记B和分子标记C的基因型，从而筛选出具有抗弧菌优势的基因型个体进行南美白对虾育种，所得结果准确、应用价值强，能够加快选育抗弧菌病性状的优良品种的选育进程，提高对虾养殖成活率具有重要的意义。