本发明涉及生物化学技术领域，提供一种微流控芯片的细胞计数方法及细胞计数装置。微流控芯片的细胞计数方法，包括：控制细胞溶液充满具有高度差的多个流道；采集每个流道内设定区域对应的目标图像，基于目标图像获取每个流道对应的细胞结团率，并确定细胞结团率最低的流道为计算流道；其中，细胞结团率为设定区域内细胞团数与总细胞数的比值；获取计算流道的目标区域内的计算细胞数；基于目标区域的面积和计算流道的高度，获取目标区域对应的预设容积，计算细胞数与预设容积的比值确定为细胞溶液的浓度。本发明提供的微流控芯片的细胞计数方法，为细胞溶液提供合适高度的流道，使得细胞溶液在流道内尽量均匀分布，使细胞计数准确率更高。