本发明公开的一种河涌水环境容量模型构建方法、系统和可读存储介质，其中方法包括：获取目标数据，其中，所述目标数据至少包括河涌河网地形数据、河涌水利工程数据、河涌水文水质数据；基于所述目标数据进行目标文件制作，其中，所述目标文件至少包括河网文件、河道断面文件以及边界条件文件；基于制作好的所述目标文件结合初始化模型构建河涌水环境容量模型，其中包括构建水动力模型以及水质模型。本发明可以基于河涌的实际水文环境进行模型构建并计算，分步筛选优化模型，使得构建到的水环境容量模型更加合理，符合不同河涌监测地的水文监测要求。