本发明涉及一种适用于总线架构的多协议兼容通信方法和系统，用于主机和多个从机之间的通信，方法包括：在主机中设置主机总线协议层软件，从机中设置从机总线协议层软件，主机中设有多个应用程序，从机中设有一个或多个从机功能块；当主机上的应用程序需要向从机功能块发送数据时，应用程序将数据报文发送至主机总线协议层软件，主机总线协议层软件生成对应从机功能块的CANid地址，并与接收到的数据报文构成数据包，发送至对应的从机；收到数据包的从机的从机总线协议层软件根据数据包解析到CANid地址和数据报文，由CANid地址对应的从机功能块处理相应的报文内容。与现有技术相比，本发明实现了交互过程解耦，提高了总线效率，提高了数据帧中有效数据占比。