本发明公开了一种大豆基因Glyma.18G041900的应用，属于植物基因工程领域。本发明克隆出一种同时控制大豆品质性状和产量性状的基因，为大豆分子辅助育种提供新线索，为高品质高产大豆育种工作提供重要理论基础。所述大豆基因Glyma.18G041900的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述大豆基因Glyma.18G041900编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明通过构建低表达和过表达基因Glyma.18G041900的转基因大豆植株，发现基因Glyma.18G041900可以调控大豆株高、百粒重、成熟子粒粒径、蛋白含量和油分含量。本发明所述基因Glyma.18G041900在改良大豆品质方面具有重要作用，适用于大豆分子育种领域。