本发明提出的一种柔直换流阀子模块电容器容值在线监测方法及系统，通过获取VBC采样数据与VBC链路传输，根据所述VBC链路传输对所述VBC采样数据进行时间补偿，其中，补偿后的所述VBC采样数据包括：桥臂电流、IGBT触发信号以及电容器电压信号；再根据所述IGBT触发信号确定电容值计算的时间区间，再根据桥臂电流得到所述时间区间的电流，根据电容器电压信号得到所述时间区间的电压差；最后根据所述时间区间内的电流和电压差计算得到电容器的计算容值。本发明实现了在不增加子模块电容值采样电路的情况下，利用现有采样数据高精度计算出电容容值，相对于现有的监测方式使电容器容值计算精度得到大幅提升。