本发明涉及三角褐指藻突变株，命名为三角褐指藻Phaeodactylum tricornutum O‑A‑6和三角褐指藻Phaeodactylum tricornutum O‑D‑6，保藏编号分别为CGMCC NO.40689和CGMCC NO.40690，保藏单位为中国普通微生物菌种保藏管理中心，保藏地址是北京市朝阳区北辰西路1号院。所述两株三角褐指藻生长快速突变株Phaeodactylum tricornutum O‑A‑6和O‑D‑6；在自养培养条件下同步培养若干天后，三角褐指藻生长快速突变株与野生型三角褐指藻相比，生长速度更快，干重更大，且岩藻黄素及二十碳五烯酸(EPA)产量也显著更高。本发明为推动三角褐指藻产业化和商业化提供了优质藻种资源。