本发明属于电力技术领域，具体地而言为一种虑灵活性改造机组协调优化运行方法及系统，该方法包括：当需要降低热电联产机组的最小电输出时，控制热电联产系统中汽轮机各级抽汽流量，将输入到汽轮机的多余热能储存起来，并将储存的热能随后用于内部储热，内部储热包括预热流经蓄热式加热的给水；以及用于外部储热，外部储热包括热电联产系统中释放或存储热功率解决严重的弃风与备用容量不足的问题，采用内部和外部两种灵活性，可以在更大程度上实现热电解耦，从而提高机组运行的灵活性。