本发明公开了一种大肠杆菌育种用管式离心机及其分离方法，所述管式离心机包括：机架组件；分离组件，包含分离筒体、以及转动安装于分离筒体内的转鼓；进料管，所述进料管伸入所述转鼓的腔内；出料组件，包含集液盘和上盖板，集液盘的底侧连接有出料管；冷凝组件，包含安装于所述分离筒体的内胆、外壳之间的弧形隔离板件，分离筒体的外壳上连接有换热介质进入管、以及换热介质排出管；减振组件，包含设置于所述分离筒体的内胆与外壳之间的弧形推料板件，所述弧形推料板件外侧的内胆与外壳之间固定装填有诸多相应的减振用阻尼粒子。本发明能够同步实现降温和减振效果，从而提升对发酵液的分离效果和提升设备的使用寿命。