本发明涉及质谱检测技术领域，具体涉及一种基于肿瘤的质谱检测方法及系统，包括以下步骤：获取质谱仪在肿瘤检测过程中环境温度数据，并根据环境温度数据进行监测分析，得到预警系数；其中，环境温度数据包括实时环境温度；基于预警系数，对质谱仪的检测工作进行判断，得到质谱检测风险信号，再根据质谱检测风险信号进行因素识别，得到风险影响因素；基于风险影响因素，生成相应地反馈工作信号；根据环境调控工作信号，获取调控系数，对当前的质谱仪环境温度进行调控；其中，调控系数包括环境温度调控速率；本发明质谱检测系统可以根据所产生的预警系数，对质谱仪进行提前干预处理，有效保证质谱检测的准确性。