本申请提出一种CTD数据的质量控制方法、装置及电子设备。该方法包括：获取CTD测量设备测量的第一观测数据，并基于第一观测数据的位置信息和深度信息，对第一观测数据进行第一次质量控制，得到观测层数据；根据观测层数据的深度，对观测层数据进行插值，得到第一标准层数据；基于第一标准层数据的深度信息，对第一标准层数据进行第二次质量控制，得到目标数据。由此，本方案通过对数据进行两次质量控制，可以对数据进行更深入的验证和校准，进一步减少误差，提高数据的精确度，进而降低数据出错的可能性，使数据更加可靠。