本发明涉及水样样本检测技术领域，具体涉及一种水样样本编码生成方法、装置、电子设备及存储介质，该方法包括：确定目标水样样本的第一检测数据；响应于第一检测数据与第一检测数据库相匹配，基于第一映射关系对第一检测数据进行数据编码，得到目标水样样本的第一编码序列；响应于第一检测数据与第一检测数据库不匹配，基于第二映射关系对第一检测数据进行数据编码，得到目标水样样本的第二编码序列；基于第一编码序列或第二编码序列确定目标水样样本的样本编码，有效解决了因工作人员水平差异和数据记录习惯多样而导致的数据处理难题，提高了数据记录的一致性和准确性，使得水样样本的分析和处理变得更加高效和便捷。