本发明提供了一种硫酸盐侵蚀水泥净浆弹性模量预测方法及系统，属于材料性能预测技术领域，包括：收集原子百分比数据集D1、XRD固态物相数据集D2和MIP孔隙率D3；将数据集D2和系统内预设数据集D进行对比，筛选特征固态物相并划分尺度；根据线性差分法用数据集D1计算不同尺度内各特征固态物相的分子百分比，得到特征固态物相体积分数数据集DV；根据尺度划分结果、数据集DV和MIP孔隙率D3，通过均匀化方法逐级计算各个尺度的弹性模量；筛选最大尺度的弹性模量值即为硫酸盐侵蚀水泥净浆弹性模量值。本发明可以解决现有弹性模量预测模型未考虑孔隙相、计算量大且计算复杂人为计算错误多等问题。