本发明提供一种靶材检测系统及靶材检测方法，其中，靶材检测系统包括：上料机构、第一输送机构、下料机构、第二输送机构以及筛选机械臂；所述第一输送机构包括输送带、压力检测组件以及多个检测工装；多个所述检测工装固定设置在所述输送带上。通过采用全自动化式的靶材检测系统，来提高靶材的检测效率，通过设置多个检测工装，顺次进行检测，减少上下料过程中的时间消耗，提高了检测效率，同时采用一个检测工装可以对靶材的多种尺寸进行检测，进一步提高来了靶材的检测效率，减少了检测工装的成本。