本申请涉及一种三维找矿预测方法、系统、设备及介质，属于地质勘探技术领域，方法包括：获取目标矿区内的地质样品数据并进行数据预处理；提取元素异常阈值并确定异常地质样品；对异常地质样品进行元素组合分析，确定原生晕元素组合；构建二维构造叠加晕实用模型，并根据各个原生晕元素的三维空间分布特征建立三维原生晕模型；基于机器学习算法对地球化学特征进行训练，建立矿化分布预测模型；将二维构造叠加晕实用模型、三维原生晕模型和矿化分布预测模型进行融合，得到三维综合找矿预测模型；根据三维综合找矿预测模型预测找矿靶区，得到找矿预测结果。本申请能够提高找矿预测的工作效率和准确度。