本发明公开了一种基于固态硬盘的端对端数据智能保护系统及方法，涉及固态硬盘领域，解决了固态硬盘端对端的数据传输过程依赖于信号基站以及传输设备的读写性能，容易导致传输中断或数据损坏、丢失的问题，包括性能测试模块、传输分析模块、综合配置模块，所述性能测试模块用于测试传输请求端和传输接收端之间的网络连接情况，所述综合配置模块用于对传输中继端的配置情况进行适应性调整，所述传输分析模块用于对待传输文件的传输作业进行困难程度分析，所述综合配置模块还用于根据传输作业等级对传输接收端中待传输文件进行文件压缩作业，本发明实现对固态硬盘传输设备的适应性调整补偿，还对固态硬盘端对端传输过程中的故障问题进行智能化处理。