本发明公开了一种二氧化碳封存有利区筛选方法。采用本申请技术方案，使得在确定二氧化碳封存的储层时，先通过饱和度筛选，确定出储层中仍有较大空间能够存储二氧化碳的储层，再通过最大二氧化碳液柱高度，对初次筛选后的储层进行安全性评估，确定出封存二氧化碳后仍较为安全的储层，并最终通过建模以及二氧化碳封存量评估，使得最终确定的二氧化碳封存有利区能够在保证安全性的基础上，封存尽可能多的二氧化碳，从而为天然气水合物系统的碳封存提供了较为系统的选址建议。