本发明公开一种压力交变工况的深海装备用涂层及其制备方法和应用，所述涂层包括富锌环氧底漆层、环氧玻璃鳞片涂层以及弹性体面漆层，所述环氧玻璃鳞片涂层包括A组分和B组分，所述A组分以重量百分比计，包括39~46.5%环氧树脂、10~15%改性玻璃鳞片、3~5%热塑性聚氨酯、1~2%聚二醇醚、7~10%颜料、0.5~1%消泡剂、2~3%助剂、20~25%溶剂，所述B组分包括环氧固化剂。本发明提供的技术方案中，首先采用防腐性能及耐水优异，附着力强的环氧富锌底漆保护深海装备的基底，然后涂装具有柔韧性能的外防护层，最后再涂覆具有弹性功能的面漆，多层防护，使得该涂层能够在较大形变条件下维持涂层不破损，在很大范围内承受水压的变化而维持原有防腐性能。