一种自由活塞式斯特林发电机混合减振系统及其方法，该系统包括减振器，减振器包括被动减振系统和主动减振系统，主动减振系统包括减振器直线电机和减振器控制系统，减振器控制系统包括减振控制器和传感器，传感器与减振控制器连接，减振控制器与减振器直线电机连接，斯特林发电机与减振器相连，减振控制器利用传感器采集的信号输出减振控制信号，驱动减振器产生与斯特林发电机相反的振动，以抵消斯特林发电机的振动。还包括一种自由活塞式斯特林发电机混合减振方法。本发明利用被动减振结合主动减振的方式，使得减振系统在被动减振的基础上减振频率可控，可灵活调节，可靠性高。