一种适用于模块化电流源变流器的容错运行方法及容错拓扑结构，所述模块化电流源变流器为多个功率单元模块交流侧及直流侧分别并联构成；其中每个功率单元模块包含有六个工作桥臂、三相交流支撑电容、两组直流储能电抗、一个辅助半桥及四个机械开关；辅助半桥由半桥正极开关、半桥负极开关构成。当模块化电流源变流器的功率单元模块发生故障时，功率单元中的半桥正极开关和半桥负极开关先切换状态后，机械开关再切换状态以实现故障的切除；当模块化电流源变流器发生外部故障时，各机械开关的状态保持不变，处于工作状态的各功率单元模块通过调节占空比实现故障穿越。