本发明公开了一种基于物联网的底栖生物养殖监控系统，涉及底栖生物养殖技术和实验研究领域，该系统通过物联网连接各类传感器和智能设备，采集水体温度、水质、流速和底层沉积污染数据，建立第一水体数据集。并建立生态池水体三维模型，计算实时水质系数SZx、水动力学系数SDx、水体底层生物群落系数QLx和底层沉积物系数CJw，提供更全面的水体健康状况评估，同时反映出底栖动物对水环境的定量化影响。利用高分辨率摄像头实时采集底栖生物行为图像视频，通过行为分析模块提取行为特征，建立行为动态分析模型，实现底栖生物运动轨迹的时序分析，并结合环境指标的评估，在实际养殖和实验研究中构建可量化可视化的底栖动物生态学效应分析过程。