本发明属于海洋防污领域，特别涉及一种表面磺酸化的有机硅水凝胶防污涂层及其制备方法。涂层由有机硅水凝胶涂层浸泡在含羟基和磺酸基的有机物的溶液中进行表面磺酸化处理获得；所述含羟基和磺酸基的有机物的溶液中含羟基和磺酸基的有机物的质量浓度为0.01～0.1g/mL。本发明的一种表面磺酸化的有机硅水凝胶防污涂层，构建了表面同时具有水化层、负电性及低表面能协同防污作用的材料表面，所制备的防污涂层具有优异的静态防污性能。该防污涂层对环境生态无污染，绿色环保，实用性强，在海洋防污领域具有广泛的应用前景。