本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas13d体系检测猪乙脑病毒的方法，属于分子生物学诊断技术领域。本发明的方法可以成功检测出临床阳性JEV样本，结合RNA荧光报告分子可对JEV进行现场可视化检测，只使用蓝光透射仪进行照射，观察反应体系扩增产物是否呈现荧光即可判定检测结果，或者使用qPCR仪对其进行定量检测，1h以内即可判定结果。本发明的引物和crRNA特异性强、敏感性好，且操作简单、检测快速、结果可视化，使得本发明建立的基于RAA和CRISPR‑Cas13d技术的检测JEV的方法可以用于JEV的现场可视化检测，从而为提高生猪养殖行业检测JEV水平，降低养殖场生物安全风险提供技术手段。