本发明公开了一种基于量子技术应用的变电站在线监测方法与系统，涉及量子变电站应用技术领域，包括：基于指令分配算法确定每一个指令请求对应的执行网关；变电站设备基于量子通信技术向监测中控终端发送请求指令；监测中控终端实时接收所有变电站设备的请求指令，并剔除其中的非法请求和无效请求，获取有效请求；识别有效请求中，是否存在导致安全风险的有效请求，若是，则将对该有效请求对应的变电站设备进行鉴权；若否，则将各有效请求发送至各执行网关进行执行。本发明的优点在于：保证变电站系统对于接入设备的请求响应速度，提高变电站系统的设备集群的指令水平，同时进而有效的保证了变电站系统的在线监测通信的安全性。