本发明公开一种基于植被垂直结构的结构化植被因子指数计算方法，本发明涉及水利技术领域，解决现有以植被投影盖度为基础的植被因子参数并未有效呈现植被垂直结构特征，往往导致植被水土保持效益较大评估误差，尚未建立能有效反映植被减水减沙效益的结构化植被因子指数的问题。本发明的一种基于植被垂直结构的结构化植被因子指数计算方法，采用机载激光雷达、CT扫描和径流小区试验相结合的方法，构建考虑植被林冠层、灌木层、草被层、枯枝落叶层、根系层和结构层次高度的结构化植被因子指数，该植被因子指数可综合反映植被的水土保持效益，比传统的植被因子指数更能有效反映植被与水土流失的关系。