本发明涉及一种网侧谐波滤除和无功补偿控制系统及方法，涉及电网并网控制领域。本申请包括用于检测负载电流中的谐波分量和基波无功电流分量并基于两者形成谐波指令值的谐波指令检测模块；获取谐波指令检测模块提供的谐波指令值，根据谐波指令值进行网侧谐波滤除和动态无功补偿控制的电流跟踪控制模块；电流跟踪控制模块电连接MMC换流器，电流跟踪控制模块根据谐波指令值包含的负载电流谐波分量和负载电流基波无功电流分量，通过基于设限分组均压的最近电平逼近调制，生成特定的触发脉冲信号，继而控制MMC换流器输出与谐波指令值大小相同、极性相反的补偿电流，并将其输送到公共端点PCC，实现对网侧谐波分量进行抵消，实现无功补偿。