本发明涉及莲子加工设备技术领域，具体公开了一种多工位自适应莲子去心机，包括机架、弹性压紧装置、弹性滚子链条、送料装置、莲子调姿装置、去心装置和控制系统。本发明通过莲子单颗送料、姿态调整，并采用弹性滚子链条和弹性压紧装置对莲子进行定位和夹紧，可有效解决不同大小的莲子在去心过程中莲子轴线与钻头轴线对齐的问题，提高莲子的去心质量。并通过在弹性滚子链条的侧面布置多组去心装置，用多把钻头同时进行去心作业，实现多工位加工。本发明结构紧凑，送料方式简单，去心质量好，生产效率高，不仅可用于干莲子去心，也可用于红枣等其它果实的去心、去核加工。