本发明公开了面向柔性互联配电网的含储能风电机组的控制系统，涉及柔性互联配电网的技术领域，包括含储能风电机组；最大功率跟踪控制模块；机侧选通控制模块；荷电状态控制模块；储能侧选通控制模块；所述含储能风电机组、最大功率跟踪控制模块、机侧选通控制模块、荷电状态控制模块以及储能侧选通控制模块相互串联。本发明给出了储能变换器的功率等级、电池容量的设计方法，使含储能的风电机组同时具备惯量响应与一次调频的功能，增强了柔性互联配电网的频率稳定性；根据电池的荷电状态和柔性互联配电网频率的变化情况，自主选择利用电池能量或风轮惯量实现惯量支撑，有利于维持电池荷电状态在较佳的状态。