本发明涉及肌醇技术领域，尤其涉及一种肌醇生产用的色谱分级提纯工艺，具体包括以下内容：将水解、浓缩后的料液采用一级色谱分离系统进行处理，控制运行温度和阀门切换时间，控制进料流速以及进料量，控制纯化水流速和进水量，经过处理收集的低盐肌醇料液再进入二级色谱分离系统进行处理，控制运行温度和阀门切换时间，控制进料流速和进料量，控制纯化水流速和进水量，经过处理收集的脱盐肌醇料液经过浓缩、降温结晶、过滤、干燥即可得到肌醇产品。上述提纯工艺，大大提高了肌醇的纯度，采用二级色谱分离系统提高了分离效率，降低了用水量。