本发明涉及一种无卤阻燃、耐高温型粉末涂料用聚酯树脂及其制备方法与应用，属于粉末涂料技术领域。本发明的无卤阻燃、耐高温型粉末涂料用聚酯树脂采用氰尿酸、环氧乙烷、二乙二醇二甲醚、3‑(3,5‑二叔丁基‑4‑羟基苯基)丙酸甲酯、亚磷酸三乙酯、新戊二醇、N‑甲基二乙醇胺、己二酸、间苯二甲酸进行聚合反应得到。该聚酯树脂与TGIC固化后的粉末涂料涂层的阻燃性能和耐高温性能优异，氧指数能够达到31％以上，耐高温性能达到250℃；且长时间沸水煮后阻燃性能和耐高温性能无明显下降，外观无明显黄变，无裂变；且该粉末涂料涂层的表观、冲击性、光泽及水煮等常规性能均达到普通市售聚酯树脂的应用要求。