本发明公开了一种具有优异抗菌耐洗性及亲肤性的两面异性棉织物及其制备方法。所述抗菌棉织物的制备方法为：步骤一、将洁净织物在高碘酸钠水溶液中反应，洗涤和干燥得到氧化棉织物；步骤二、将聚乙烯醇和2,3,4‑三羟基苯甲醛的混和溶液经空气压缩雾化器雾化到氧化棉织物的一侧，干热处理得到单面改性棉织物；步骤三、将胶原蛋白溶液经空气压缩雾化器雾化到经步骤二处理所得棉织物的另一侧，干热处理得到两面异性棉织物。本发明采用细雾处理技术对棉织物两侧分别进行抗菌及亲肤表面改性，所得棉织物具有优异抗菌和耐洗性能，具有良好生物安全性，同时提高了穿着舒适性。