本申请涉及气动比例阀的领域，尤其是涉及一种气动比例阀的精确控制方法、系统及其存储介质，其包括获取设置流量值，采集获取实际流量值；通过所述设置流量值与预设的阀芯开启冲击阈值确定受冲击系数；通过所述实际流量值、所述受冲击系数、预设的冲击系数确定预计膜片偏移值；通过所述预计膜片偏移值与预设的弹簧反馈阈值确定预计膜片调整值；通过所述实际流量值与所述设置流量值确定流量偏差值；通过所述流量偏差值、预设的流量启动阈值与所述预计膜片调整值确定调整信号，并输出。本申请具有提高控制精度与稳定性的效果。