本发明公开了一种原子精确金团簇配体交换的方法，包括：将干燥的含磷配体的金团簇溶于二氯甲烷中，形成第一溶液；将硫醇配体溶于去离子水中，形成第二溶液；将第一溶液和第二溶液混合，在低温下剧烈搅拌反应；反应完成后分离出水相，经超滤、冷冻干燥后，得到含有硫醇配体的金团簇。本发明通过简单的低温调控，以动力学的方式来实现硫醇与磷的配体交换，使配体交换后的团簇可溶于水，并引入手性，将其功能化。本发明所述的方法具有操作容易、适用性广泛等特点。