本发明公开了一种流域内调水工程的动态调水方法，属于调水工程领域，包括：将流域内河流可供水的范围作为主动辐射范围，流域的供水范围内去掉主动辐射范围剩下的区域作为被动辐射范围；将河流拆分成若干供水段，每个供水段两侧的主动辐射范围为主动辐射单元，将被动辐射范围拆分成若干被动辐射单元，计算主动辐射单元与被动辐射单元的需水量；根据被动辐射单元与主动辐射单元之间的需水量，计算每个供水段的向内调水量、向外调水量，建立流域内供水段之间进行水调度的成本模型；考虑各供水段的向内调水量、向外调水量，以及根据成本模型计算出的供水段之间的调水成本，动态规划供水段之间的调水路径。